O Flamengo viveu um momento significativo no final de outubro e início de novembro de 2024, sob a presidência de Rodolfo Landim. José Boto, um profissional com vasta experiência em clubes europeus, decidiu se envolver profundamente nos bastidores do Rubro-Negro. Faltando cerca de dois meses para a eleição presidencial da Gávea, o português aceitou o desafio de ser o responsável pelo futebol do candidato Luiz Eduardo Baptista, conhecido como Bap. O resultado dessa escolha foi a vitória de Bap nas eleições, onde ele enfrentou e superou os candidatos Rodrigo Dunshee e Maurício Gomes de Mattos.

Curiosamente, Boto não conhecia Bap antes de receber uma ligação inesperada de um número desconhecido no Brasil. Em uma conversa que durou poucos minutos, começou a surgir um novo projeto esportivo para o Flamengo. Apesar de estar vinculado ao NK Osijek, da Croácia, o dirigente não hesitou em aceitar o convite, abrindo mão até mesmo de um salário vantajoso na Europa. Apaixonado pelo Brasil e com uma carreira que inclui passagens por clubes como Benfica, Shakhtar Donetsk e PAOK, José Boto firmou um contrato até dezembro de 2026 e recebeu total liberdade para conduzir o futebol do Flamengo a partir de 2025.

Antes de ser oficialmente nomeado, Boto já demonstrou influência ao convencer Bap a reter e investir na permanência do experiente Filipe Luís. Com a colaboração do técnico rubro-negro, ele iniciou um processo de reconstrução e fortalecimento do elenco. Entre as transações realizadas, destacam-se as chegadas de jogadores como Emerson Royal, Samuel Lino, Jorge Carrascal, além de renomados internacionais como Danilo, Alex Sandro, Jorginho e Saúl. Contudo, a caminhada não foi isenta de dificuldades.

José Boto enfrentou críticas severas, especialmente da mídia, em setembro, quando a diretoria considerou a possibilidade de negociar Pedro. Essa situação gerou descontentamento entre os torcedores, que se opuseram fortemente à tentativa de contratação do irlandês Mikey Johnston, jogador do West Bromwich, da segunda divisão inglesa. As reações negativas nas redes sociais acabaram por inviabilizar o negócio.

Atualmente, Boto se prepara para a final da CONMEBOL Libertadores de 2025 e continua a luta pelo Campeonato Brasileiro. Aos 59 anos, ele busca conquistar o título de número 23 na carreira, somando 16 conquistas em Portugal, quatro na Ucrânia e dois títulos já conquistados pelo Flamengo: Campeonato Carioca e Supercopa do Brasil. Os próximos desafios do Flamengo incluem as partidas contra o Sport, São Paulo e Santos, todas válidas pelo Brasileirão.